Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd2E9PZM4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chd2E9PZM4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd2E9PZM4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms