Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930595D18RikD3Z642 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930595D18RikD3Z642 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms