Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc8D3YZV8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc8D3YZV8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms