Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pnldc1B2RXZ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pnldc1B2RXZ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pnldc1B2RXZ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms