Protein–RNA interactions for Protein: B2RW88

Prr19, Proline-rich 19, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr19B2RW88 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prr19B2RW88 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr19B2RW88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms