Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfap58B2RW38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap58B2RW38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms