Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Abcc8B2RUS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Abcc8B2RUS7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Abcc8B2RUS7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms