Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms