Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spocd1B1ASB6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spocd1B1ASB6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spocd1B1ASB6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms