Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Supt3B0QZW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Supt3B0QZW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms