Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Skint2A7XUX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skint2A7XUX6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms