Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htra4A2RT60 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htra4A2RT60 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms