Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1jA2BFR3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al1jA2BFR3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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