Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Upf2A2AT37 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf2A2AT37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms