Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhbdl2A2AGA4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl2A2AGA4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms