Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms