Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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