Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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