Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm15041-201ENSMUST00000119048 756 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Vmn1r-ps114-201ENSMUST00000121050 1040 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm8379-201ENSMUST00000165448 1192 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cd209b-203ENSMUST00000171635 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm2907-201ENSMUST00000181256 1192 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pdzk1ip1-201ENSMUST00000030488 1119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps29P62274 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms