Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm8425-201ENSMUST00000171395 769 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CitP49025 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CitP49025 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CitP49025 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CitP49025 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CitP49025 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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