Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms