Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atf6F6VAN0 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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