Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mcm5-201ENSMUST00000164309 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Q9CPS8 Tmem19-204ENSMUST00000217887 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gdi2-201ENSMUST00000059515 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Lysmd4-204ENSMUST00000207823 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CPS8 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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