Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprdQ64487 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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PtprdQ64487 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PtprdQ64487 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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