Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 1700034J05Rik-201ENSMUST00000036592 3007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm22659-201ENSMUST00000104195 130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 1700019N19Rik-202ENSMUST00000166692 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mir3093-201ENSMUST00000175247 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 9030619P08Rik-202ENSMUST00000190141 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Cx3cl1-206ENSMUST00000211956 470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Taar3-201ENSMUST00000045152 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm5499-201ENSMUST00000090731 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ica1l-205ENSMUST00000189776 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sntg1-202ENSMUST00000115488 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 4930528P14Rik-201ENSMUST00000152815 509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm29718-201ENSMUST00000193396 477 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm46188-201ENSMUST00000219927 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gpatch4-202ENSMUST00000166021 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 2700029L08Rik-201ENSMUST00000202895 1465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 1810021B22Rik-205ENSMUST00000162579 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm17169-201ENSMUST00000171382 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mir6965-201ENSMUST00000184733 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm6637-201ENSMUST00000204884 382 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Cbr1-201ENSMUST00000039659 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm16063-201ENSMUST00000156235 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm8310-201ENSMUST00000117526 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms