Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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