Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CitP49025 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CitP49025 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CitP49025 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CitP49025 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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