Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zbed5B2RPU8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms