Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms