Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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