Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms