Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc21aQ8C0S4 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc21aQ8C0S4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc21aQ8C0S4 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc21aQ8C0S4 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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