Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PtprqP0C5E4 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PtprqP0C5E4 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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PtprqP0C5E4 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprqP0C5E4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms