Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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