Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClgnP52194 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ClgnP52194 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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