Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprqP0C5E4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms