Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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