Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac6Q9Z2V5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac6Q9Z2V5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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