Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mbd4Q9Z2D7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mbd4Q9Z2D7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms