Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6ka4Q9Z2B9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka4Q9Z2B9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms