Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp1Q9Z273 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp1Q9Z273 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms