Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek4Q9Z1J2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek4Q9Z1J2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms