Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cog1Q9Z160 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cog1Q9Z160 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms