Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema4fQ9Z123 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema4fQ9Z123 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms