Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Itsn2Q9Z0R6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Itsn2Q9Z0R6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itsn2Q9Z0R6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms