Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn1Q9Z0I7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn1Q9Z0I7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms