Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GNEQ9Y223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNEQ9Y223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms