Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msl3Q9WVG9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msl3Q9WVG9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms