Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms