Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms